真菌（學(xué)名：Fungi），是一種具真核的、產(chǎn)孢的、無(wú)葉綠體的真核生物。包含霉菌、酵母、蕈菌以及其他人類(lèi)所熟知的菌菇類(lèi)。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了十二萬(wàn)多種真菌。真菌獨(dú)立于動(dòng)物、植物和其他真核生物，自成一界。真菌的細(xì)胞有含甲殼素，能通過(guò)無(wú)性繁殖和有性繁殖的方式產(chǎn)生孢子。
繁殖方法
無(wú)性繁殖
無(wú)性繁殖（asexual reproduction）是指營(yíng)養(yǎng)體不經(jīng)過(guò)核配和減數(shù)分裂產(chǎn)生后代個(gè)體的繁殖。它的基本特征是營(yíng)養(yǎng)繁殖通常直接由菌絲分化產(chǎn)生無(wú)性孢子。常見(jiàn)的無(wú)性孢子有三種類(lèi)型：
（1）游動(dòng)孢子（zoospore）：形成于游動(dòng)孢子囊（zoosporangium）內(nèi)。游動(dòng)孢子囊由菌絲或孢囊梗頂端膨大而成。游動(dòng)孢子無(wú)細(xì)胞壁，具1-2根鞭毛，釋放后能在水中游動(dòng)。
（2）孢囊孢子（sporangiospore）：形成于孢囊孢子囊（sporangium）內(nèi)。孢子囊由孢囊梗的頂端膨大而成。孢囊孢子有細(xì)胞壁，水生型有鞭毛，釋放后可隨風(fēng)飛散。
（3）分生孢子（conidium）產(chǎn)生于由菌絲分化而形成的分生孢子梗（conidiophore）上，頂生、側(cè)生或串生，形狀、大小多種多樣，單胞或多胞，無(wú)色或有色，成熟后從孢子梗上脫落。有些真菌的分生孢子和分生孢子梗還著生在分生孢子果內(nèi)。孢子果主要有兩種類(lèi)型，即近球形的具孔口的分生孢子器（pycnidium）和杯狀或盤(pán)狀的分生孢子盤(pán)（acervulus）
有性繁殖
真菌生長(zhǎng)發(fā)育到一定時(shí)期（一般到后期）就進(jìn)行有性生殖（sexual reproduction）。有性生殖是經(jīng)過(guò)兩個(gè)性細(xì)胞結(jié)合后細(xì)胞核產(chǎn)生減數(shù)分裂產(chǎn)生孢子的繁殖方式。多數(shù)真菌由菌絲分化產(chǎn)生性器官即配子囊（gametangium），通過(guò)雌、雄配子囊結(jié)合形成有性孢子。其整個(gè)過(guò)程可分為質(zhì)配（plasmogamy）、核配（karyogamy）和減數(shù)分裂（meiosis）三個(gè)階段。
第一階段：質(zhì)配階段，即經(jīng)過(guò)兩個(gè)性細(xì)胞的融合，兩者的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核（N）合并在同一細(xì)胞中，形成雙核期（N+N）。
第二階段：核配階段，就是在融合的細(xì)胞內(nèi)兩個(gè)單倍體（haploid）的細(xì)胞核結(jié)合成一個(gè)雙倍體的核（2N）。
第三階段：減數(shù)分裂階段，雙倍體（diploid）細(xì)胞核經(jīng)過(guò)兩次連續(xù)的分裂，形成四個(gè)單倍體的核（N），從而回到原來(lái)的單倍體階段。經(jīng)過(guò)有性生殖，真菌可產(chǎn)生四種類(lèi)型的有性孢子。
（1）卵孢子（oospore）：卵菌的有性孢子。是由兩個(gè)異型配子囊——雄器和藏卵器接觸后，雄器的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核經(jīng)授精管進(jìn)入藏卵器，與卵球核配，最后受精的卵球發(fā)育成厚壁的、雙倍體的卵孢子。
（2）接合孢子（zygospore）：接合菌的有性孢子。是由兩個(gè)配子囊以配子囊結(jié)合的方式融合成1個(gè)細(xì)胞，并在這個(gè)細(xì)胞中進(jìn)行質(zhì)配和核配后形成的厚壁孢子。
（3）子囊孢子（ascospore）：子囊菌的有性孢子。通常是由兩個(gè)異型配子囊——雄器和產(chǎn)囊體相結(jié)合，經(jīng)質(zhì)配、核配和減數(shù)分裂而形成的單倍體孢子。子囊孢子著生在無(wú)色透明、棒狀或卵圓形的囊狀結(jié)構(gòu)即子囊（ascus）內(nèi)。每個(gè)子囊中一般形成8個(gè)子囊孢子。子囊通常產(chǎn)生在具包被的子囊果內(nèi)。子囊果一般有四種類(lèi)型，即球狀而無(wú)孔口的閉囊殼（cletothecium），瓶狀或球狀且有真正殼壁和固定孔口的子囊殼（perithecium），由于座溶解而成的、無(wú)真正殼壁和固定孔口的子囊腔（locule），以及盤(pán)狀或杯狀的子囊盤(pán)（apothecium）。
（4）擔(dān)孢子（basidiospore）：擔(dān)子菌的有性孢子。通常是直接由“+"、“-"菌絲結(jié)合形成雙核菌絲，以后雙核菌絲的頂端細(xì)胞膨大成棒狀的擔(dān)子（basidium）。在擔(dān)子內(nèi)的雙核經(jīng)過(guò)核配和減數(shù)分裂，最后在擔(dān)子上產(chǎn)生4個(gè)外生的單倍體的擔(dān)孢子。
此外，有些低等真菌如根腫菌和壺菌產(chǎn)生的有性孢子是一種由游動(dòng)配子結(jié)合成合子，再由合子發(fā)育而成的厚壁的休眠孢子（restingspore）。
分類(lèi)
真菌較高層級(jí)的分類(lèi)系統(tǒng)仍有很大爭(zhēng)議，新理論不斷被提出，各個(gè)分類(lèi)階層的名稱(chēng)均常有變動(dòng)。且同一種真菌還可能在生活史的不同階段，例如無(wú)性與有性世代擁有數(shù)種不同的學(xué)名，使真菌分類(lèi)更加復(fù)雜?！栋藏愂暇镌~典》第9版中，將真菌界分為4門(mén)和1類(lèi)。
壺菌門(mén)
壺菌門(mén)（Chytridiomycota）壺菌門(mén)是游動(dòng)細(xì)胞具有“9+2"結(jié)構(gòu)的鞭毛，并能在水中游動(dòng)的一類(lèi)真菌，游動(dòng)孢子具有一根后生尾鞭式鞭毛。
接合菌門(mén)
接合菌門(mén)（Zygomycota）是由低等的水生真菌發(fā)展到陸生種類(lèi)，由游動(dòng)的帶鞭毛的孢囊孢子發(fā)展為不游動(dòng)的孢囊孢子——靜孢子或單孢孢子囊的分生孢子。
子囊菌門(mén)
子囊菌門(mén)（Ascomycota）是真菌中最大的類(lèi)群他與擔(dān)子菌被稱(chēng)為高等真菌，生殖菌絲細(xì)胞出現(xiàn)較短雙核階段，其區(qū)別于其他真菌的一個(gè)特征是產(chǎn)生子囊。
擔(dān)子菌門(mén)
擔(dān)子菌門(mén)（Basidiomycota）是一類(lèi)高等真菌，構(gòu)成雙核亞界，包含2萬(wàn)多種，包括蘑菇、木耳等主要食用菌。更具體地說(shuō)，擔(dān)子菌門(mén)包括以下組：蘑菇，馬勃，stinkhorns（鬼筆科），支架真菌，和人體致病酵母隱球菌屬等等。
半知菌類(lèi)
半知菌類(lèi)（Deuteromycota）是一種已廢止的生物分類(lèi)，指在子囊菌、擔(dān)子菌的同伴之中，還未發(fā)現(xiàn)有性繁殖階段而在分類(lèi)學(xué)上位置不明的一種臨時(shí)分類(lèi)。只進(jìn)行無(wú)性繁殖的菌類(lèi)被稱(chēng)作不*型，這一階段被稱(chēng)為無(wú)性階段。進(jìn)行有性繁殖的被稱(chēng)為*型，該階段被稱(chēng)作有性階段，通常有性階段的菌類(lèi)也是同時(shí)進(jìn)行無(wú)性生殖的。
